تكمن هذه الصعوبة في عدم القدرة على تصور أو تمثيل كيف تتفاعل الكائنات الحية مع بعضها البعض في بيئتها ودور الكائنات الحية المختلفة في الحفاظ على توازن النظام البيئي. وكذلك صعوبة في فهم كيفية انتقال الطاقة والمواد الغذائية من كائن حي إلى آخر. وصعوبة في رسم وتفسير السلاسل الغذائية البسيطة وتحويلها إلى شبكات غذائية أكثر تعقيداً.