تتمثل الصعوبة في علاج التصور الخاطئ لدى الطلاب الذي يعتقدون أن النباتات تحصل على غذائها من التربة عبر الجذور وتخزنه في الأوراق، حيث يؤدي هذا التصور إلى فهم غير دقيق لعملية التمثيل الضوئي، وإهمال دور الضوء كمصدر أساسي للطاقة، وسوء فهم لدور الجذور التي تمتص الماء والمعادن الضرورية.